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常用ALK检查的四种方式并不能100%确定患者是否阳性

2019年02月01日 作者:美中嘉和肿瘤防治科普团队

所属类型

肺癌

非小细胞肺腺癌中ALK基因突变的频率在2%-7%。比靶向治疗药物更为关键的是对于ALK的检查。目前已经获得批准的检查方法包括:荧光原位免疫杂交(FISH)检查、免疫组化(IHC)检查、针对ALK融合突变的逆转录PCR检查,二代基因测序(NGS)法。但在实际应用中,发现其中本应结果一致的检查方法也是有差别的,对于一些ALK阴性的报告结果,还是需要做出一些讨论的。


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针对ALK突变的四种检查方法的对比,可以从检测灵敏度和特异度两方面进行。灵敏度是指对ALK突变样本的检查中检出比例;特异度则是对ALK突变没有发生突变的样本检测出来的能力,即判断为真阴性的比例。


(一)使用NGS二代测序技术和RT-PCR逆转录检查的灵敏度对比


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(二)采用同样60个样本对不同ALK检测四种不同方法对比


55个样本的检测结果是一致的,包含43个ALK阳性的样本,12个ALK阴性的样本。另外有5个样本的检测结果不一致。也就是说四种检测方法的相似度可以达到91.7%。但反过来也就是说,有8.3%的患者,使用不同的检测方法结果会显示不一致。这在检测中有可能导致部分患者错过最佳治疗方案。


(三)使用免疫组化IHC和原位免疫荧光杂交FISH两种技术检测的一致性结果作为标准


RT-PCR逆转录检查的灵敏度是7%,特异性是87.1%;


NGS二代测序检测的灵敏度是85%,特异性是79%。


(四)将免疫组化IHC与RT-PCR或二代测序结合起来来测定结果


其灵敏度没有提示;


IHC+RT-PCR的特异性提升至88.7%;


IHC+NGS二代测序的特异性达到83.9%。


对于使用不同检测方法,而最终结果不一致的情况,除了检测方法外,还与获取的样本是否准确以及检测人员的评估能(shui)力(ping)有关。


比如:免疫组化IHC很可能是失败的染色技术,或者穿刺的样本里癌细胞比例不够(比如穿错或传偏位置)。


一般来说原位免疫荧光杂交FISH是ALK检测的金标准(最为准确的检查),但是如果按照对比的结果,并不能得到无可置疑的结果,分析看是受限于病理技师的准确评估,比如计数多少个算是阳性等,也难免有出错。


逆转录PCR的局限性只能检测已知的易位,如果一个易位不常见就漏检了。还有一个原因是有些样本不一样能提取出来RNA,不像是DNA,RNA很容易降解,而RNA质量影响了检测结果。


最后说下二代基因测序NGS。部分原因可能是与建库,样本取材有一定关系。


对于四种不同检测技术在这几十个样本中存在部分不一致情况,提示即使在现代医疗检查条件下,医生不能将检测报告的结果完全地绝对化,必要时可以考虑使用另外的技术再次做验证。给大家介绍不同检查结果存在不一致问题,并不是质疑医学检查,而是尊重医学在当下科技条件下可能出现的问题。对于ALK的基因检测仍会出现差错,因此需要医生通过其它验证来增加检查的准确度。

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关键词

ALK基因突变 四种检查方法 肺癌

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